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qPCR實(shí)驗為什么要制作熔解曲線(xiàn)?
發(fā)布時(shí)間: 2021-10-11 點(diǎn)擊次數: 3924次熒光DNA結合染料法的缺點(diǎn)是它們能在反應中結合所有DNA雙鏈,包括在實(shí)時(shí)熒光PCR中產(chǎn)生的引物二聚體,和其他非特異性產(chǎn)物,引起大量的背景噪聲信號。
這種噪聲會(huì )影響我們對靶基因產(chǎn)量的評估,甚至熒光強度和靶基因的起始量、全長(cháng)根本沒(méi)什么關(guān)系。
因此,我們使用熒光DNA染料結合法時(shí),需要對擴增產(chǎn)物進(jìn)行熔解曲線(xiàn)的分析。通過(guò)對擴增反應產(chǎn)物逐漸升溫,同時(shí)監測每一步的熒光信號來(lái)制作熔解曲線(xiàn)。
熔解曲線(xiàn)的縱坐標是熒光信號值,橫坐標是溫度值。通過(guò)觀(guān)察產(chǎn)生的信號峰和對應溫度,可以判斷產(chǎn)物狀態(tài)。
理想情況下,熔解曲線(xiàn)應該是單峰,峰值對應溫度是特異性產(chǎn)物的退火溫度,這才能說(shuō)明擴增產(chǎn)物中特異性產(chǎn)物占比大。熒光DNA結合染料法的缺點(diǎn)是它們能在反應中結合所有DNA雙鏈,包括在實(shí)時(shí)熒光PCR中產(chǎn)生的引物二聚體,和其他非特異性產(chǎn)物,引起大量的背景噪聲信號。
這種噪聲會(huì )影響我們對靶基因產(chǎn)量的評估,甚至熒光強度和靶基因的起始量、全長(cháng)根本沒(méi)什么關(guān)系。
因此,我們使用熒光DNA染料結合法時(shí),需要對擴增產(chǎn)物進(jìn)行熔解曲線(xiàn)的分析。通過(guò)對擴增反應產(chǎn)物逐漸升溫,同時(shí)監測每一步的熒光信號來(lái)制作熔解曲線(xiàn)。
熔解曲線(xiàn)的縱坐標是熒光信號值,橫坐標是溫度值。通過(guò)觀(guān)察產(chǎn)生的信號峰和對應溫度,可以判斷產(chǎn)物狀態(tài)。
理想情況下,熔解曲線(xiàn)應該是單峰,峰值對應溫度是特異性產(chǎn)物的退火溫度,這才能說(shuō)明擴增產(chǎn)物中特異性產(chǎn)物占比大。
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