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    非基因組DNA的提取

    發(fā)布時(shí)間: 2021-10-22  點(diǎn)擊次數: 1156次

    一、DNA提取方法簡(jiǎn)介

    1、基因組DNA的提取

    1.1、CTAB法

    1.2、SDS

    1.3、其它

    2、非基因組DNA的提取

    2.1、質(zhì)粒DNA的提取

    2.1.1、堿裂解法

    2.1.2、煮沸法

    2.2、線(xiàn)粒體、葉綠體DNA的提取

    差速離心結合SDS裂解法

    2、非基因組DNA的提取

    2.1、質(zhì)粒DNA的提取

    2.1.1、堿裂解法

    堿裂解法原理

    染色體DNA比質(zhì)粒DNA分子大得多,且染色體DNA為線(xiàn)狀分子,而質(zhì)粒DNA為共價(jià)閉合環(huán)狀分子;

    當用堿處理DNA溶液時(shí),線(xiàn)狀染色體DNA容易發(fā)生變性,共價(jià)閉環(huán)的質(zhì)粒DNA在回到中性pH時(shí)即恢復其天然構象;

    變性染色體DNA片段與變性蛋白質(zhì)和細胞碎片結合形成沉淀,而復性的超螺旋質(zhì)粒DNA分子則以溶解狀態(tài)存在液相中,從而可通過(guò)離心將兩者分開(kāi)。

    堿裂解法流程圖

     

    圖片


    SDS堿裂解法提取質(zhì)粒DNA中溶液1的成分及作用

    溶液Ⅰ  50mM 葡萄糖 / 10mM EDTA / 25mM Tris-HCl,pH=8.0 葡萄糖增稠,使懸浮后的大腸桿菌不會(huì )快速沉積到管子的底部;EDTA 抑制DNase的活性。這一步溶液中還可以加入RNase,不受EDTA影響,并且可以在后續步驟中被除去

    溶液Ⅱ   0.2M NaOH / 1% SDS 破細胞的主要是堿,而不是SDS,所以才叫堿法抽提

    溶液III   3M 醋酸鉀 / 2M 醋酸

    這一步的K置換了SDS(十二烷基磺酸鈉)中的Na,得到PDS(十二烷基磺酸鉀)沉淀;SDS易與蛋白質(zhì)結合,平均兩個(gè)氨基酸上結合一個(gè)SDS分子,鉀鈉離子置換所產(chǎn)生的大量沉淀自然就將絕大部分蛋白質(zhì)也沉淀了,同時(shí)基因組DNA也被PDS共沉淀。 

    2.1.2、煮沸法

    煮沸法原理

    染色體DNA比質(zhì)粒DNA分子大得多,且染色體DNA為線(xiàn)狀分子,而質(zhì)粒DNA為共價(jià)閉合環(huán)狀分子;

    當加熱處理DNA溶液時(shí),線(xiàn)狀染色體DNA容易發(fā)生變性,共價(jià)閉環(huán)的質(zhì)粒DNA在冷卻時(shí)即恢復其天然構象;

    變性染色體DNA片段與變性蛋白質(zhì)和細胞碎片結合形成沉淀,而復性的超螺旋質(zhì)粒DNA分子則以溶解狀態(tài)存在液相中,從而可通過(guò)離心將兩者分開(kāi)。


    2.2、線(xiàn)粒體、葉綠體DNA的提取

    線(xiàn)粒體和葉綠體是生物體內半自主性細胞器,自身可編碼蛋白,它們的比重和大小一定,因而在同一離心場(chǎng)內的沉降速度也一定,根據這一原理,常用不同轉速的離心法,將細胞內各種組分分級分離出來(lái)。

    差速離心法原理

    是利用物質(zhì)比重的不同分離混合物的一種方法。

    將待分離物質(zhì)置于均勻介質(zhì)(蔗糖)中,以一定的轉速進(jìn)行離心,比重大的物質(zhì)優(yōu)先沉降,比重小的卻處于上層,從而得以分離。


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