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    如何快速測量細胞劃痕寬度?

    發(fā)布時(shí)間: 2021-12-22  點(diǎn)擊次數: 1332次

    細胞劃痕實(shí)驗可謂是性?xún)r(jià)比高的一個(gè)小實(shí)驗了??梢栽诓活~外購買(mǎi)實(shí)驗設備的情況下,一定程度地評價(jià)腫瘤細胞或者成纖維細胞的遷移能力。


    圖片


    在課題組經(jīng)費的限制下,這個(gè)實(shí)驗成為很多老板的*。



    細胞劃痕實(shí)驗本身的操作很簡(jiǎn)單,網(wǎng)上有很多教程,此處不贅述。當你辛辛苦苦拿到了下面這張照片時(shí),說(shuō)明你已經(jīng)成功了一大半。


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    接下來(lái)的工作就是測量,本文將以此為例,寫(xiě)出測量的圖文教程。




    1. 下載并安裝Image Pro Plus。


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    2. 點(diǎn)擊File→Open,打開(kāi)你需要測量的圖片。

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    3. 增強細胞劃痕邊界的信號,以提高IPP識別準確度。點(diǎn)擊Process,點(diǎn)擊過(guò)濾器Filters。

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    4. 在Filters彈窗中,依次選擇以下參數,需要做3步。



    (4.1)在Edge選項下,選擇Sobel。然后鼠標拖右側的小窗口,將細胞劃痕的邊緣拖到這個(gè)窗口處,意在增強這個(gè)邊界。

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    點(diǎn)擊Apply之后,可以看到目標圖片已經(jīng)發(fā)生改變,邊界更加清晰了。


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    (4.2)在Morphological選項下,選擇Close。然后鼠標拖右側的小窗口,使得細胞占滿(mǎn)這個(gè)窗口。此步意在通過(guò)算法將細胞區域中的空隙都填充上顏色,以提高IPP的自動(dòng)識別準確度。


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    點(diǎn)擊Apply之后,可以看到目標圖片再次發(fā)生改變。


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    (4.3)在Enhancement選項下,選擇Lopass,選擇5X5,然后鼠標拖右側的小窗口,使得劃痕邊界處在這個(gè)窗口。此步驟意在調整劃痕邊界的平滑度。


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    點(diǎn)擊Apply之后,可以看到目標圖片又一次發(fā)生改變。


    image.png


    5. 增強圖片的對比度。


    (5.1)點(diǎn)擊Enhance,選擇Contrast Enhancement,調出下面的設置界面彈窗。


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    (5.2)拉動(dòng)圖中的曲線(xiàn),以獲取合適的對比度。(當然你也可以點(diǎn)擊彈窗中Save選項,保存這個(gè)對比度文件。后面測量其它圖片時(shí),到了這一步可以點(diǎn)擊Load調出設置文件。這種操作更有利于減小測量誤差。)


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    6. 點(diǎn)擊矩形工具,將圖中的細胞寬度框選。如下圖。


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    7. 點(diǎn)擊Measure中的count/size選項,彈框中點(diǎn)擊measrue,再點(diǎn)擊select measurement。測量參數選擇Area和Box Height。調整Area最小測量值為1000,以便于過(guò)濾小面積區域。(注意:如果你的細胞劃痕圖像是橫著(zhù)的,那就要選擇Box width)。點(diǎn)擊OK。



    8. 最關(guān)鍵的一步。在manual模式下,點(diǎn)擊select colors,進(jìn)入選色界面。在HSI模式下通過(guò)調整0-255數值或拉動(dòng)圖中曲線(xiàn),保證我們畫(huà)的矩形選框中盡可能的被填滿(mǎn)紅色。


    同樣的,你可以點(diǎn)擊彈窗中的File按鈕來(lái)保存你的設置文件,測量其它圖片時(shí)之間調用,以減小測量誤差。完成后點(diǎn)擊close。



    9. 在count/size界面選擇Option,然后按照下圖進(jìn)行設置。最關(guān)鍵的是選擇filled。完成后點(diǎn)擊OK。



    10. 點(diǎn)擊count,可以看到劃痕區域被選擇為多個(gè)測量區域,且存在一個(gè)最大測量區域被紅色全部充滿(mǎn)。這樣的測量才是符合的。


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    11. 點(diǎn)擊View,查看數據。其中最大面積及其對應的高度值就是我們需要的數據。



    12. 細胞劃痕寬度



    細胞劃痕平均寬度=細胞劃痕最大測量面積 / 對應的長(cháng)度



    (eg,本例中細胞劃痕最大的測量面積是1954623,對應長(cháng)度為2531,那么細胞劃痕平均寬度就是772.3)


    13. 測量單位的問(wèn)題


    首先,你的所有圖片應該是在同一倍數的鏡下拍攝,一般10X。此時(shí)你采用IPP測量的寬度數值單位是“像素",如果是多組間的比較,是否有單位對于組間比較無(wú)影響。


    至于這個(gè)像素所代表的實(shí)際尺寸,則必須在該顯微鏡10X倍數下重新拍攝一個(gè)標尺,然后使用這個(gè)標尺進(jìn)行像素與尺寸的換算,最終得到細胞劃寬度的實(shí)際尺寸。



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