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    細胞自噬的相關(guān)研究,有這篇就足夠了!

    發(fā)布時(shí)間: 2022-02-15  點(diǎn)擊次數: 1497次

    自噬(autophagy)被認為是維持細胞穩態(tài)的關(guān)鍵過(guò)程,也是對等壓力源的反應,如營(yíng)養缺乏,這可能會(huì )危及細胞的生存。當細胞接觸到這些壓力源時(shí),原本在低水平發(fā)生以平衡生物分子的恒定合成的自噬,就會(huì )被大幅度上調。這種上調會(huì )增加了細胞的吸收和降解,將大分子釋放回胞質(zhì)中以驅動(dòng)必須的代謝反應并產(chǎn)生能量。

    在正常和壓力條件下,自噬對細胞健康的貢獻,意味著(zhù)這種嚴格調控和精確協(xié)調過(guò)程的重要生理和病理作用。事實(shí)上,自噬在哺乳動(dòng)物的發(fā)育過(guò)程中被發(fā)現是有用的。此外,最近的研究發(fā)現自噬是各種疾病和病癥的重要調節器。探索自噬在發(fā)育和疾病中的參與,對于更全面地了解這一途徑的作用至關(guān)重要,并且可能對保持健康或治療疾病有影響。

    自噬的研究已經(jīng)成為如今醫學(xué)研究的???,發(fā)文量也十分巨大,成為常規生物學(xué)現象來(lái)研究,但是有一些實(shí)驗上的技巧值得探討一二,例如一些試劑的使用等等

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    1、自噬相關(guān)試劑的使用。

    ①MDC:取12 mg粉末溶于720 nl DMSO使其濃度為50 mmol/L,分裝后-20冰箱保存。臨用前用MEM稀釋到終濃度50 umol/L;

    ②Rapamycin:用MEM培養基配成終濃度為1 umol/L,現用現配;

    400ng/ml喹乙醇:稱(chēng)取4 mg喹乙醇,DMSO預溶(體積<0.1%)后加入10 ml MEM培養液至*溶解,現用現配,避光保存;

    ③3-MA:首先用PBS溶解粉末,臨用前加熱至*溶解后再加入MEM培養基至終濃度10mmol/L;PI3K抑制劑(3-MA,Wortmannin)可干擾或阻斷自噬體的形成;

    用RAPAMYCIN誘導自噬我也查過(guò)一部分文獻,有用無(wú)血清的,也有用,一般培養基的,濃度從25nM到100nM都有,用的是50nM的雷帕霉素,加入一般的培養基中,目的是排除無(wú)血清所誘導出來(lái)的自噬。

     文獻說(shuō)饑餓初期激活的是大分子自噬,在4-6小時(shí)活力達到最大,24h后以CMA途徑為主

    ④Earle's balanced salts solution (EBSS) for 48 h

    sigma的EBSS,貨號E2888,有碳酸氫鈉,有酚紅的,酚紅到不是很必須,只是一個(gè)PH指示作用,好看些

    ⑤無(wú)血清誘導自噬:EBSS 誘導6個(gè)小時(shí)就可以了。

    EBSS一定可以誘導出來(lái),只是需要說(shuō)明的是時(shí)間點(diǎn)的設置,因為從饑餓誘導開(kāi)始半個(gè)小時(shí)就可能開(kāi)始自噬了,一直到24小時(shí)都持續,所以應該設置不同的時(shí)間點(diǎn)觀(guān)察這個(gè)作用。另外一個(gè)很大的問(wèn)題是,饑餓誘導的一個(gè)很大的弊端是細胞死亡,這也是我面臨的問(wèn)題,就是在細胞收養的時(shí)候蛋白濃度太小了。24小時(shí)就很少了,更不要說(shuō)48小時(shí)和72小時(shí)了。

    ⑥Hank's誘導,也就是通常所說(shuō)的饑餓誘導,細胞培養到對數生長(cháng)期后以Hank's替代常規*培養基,3h后就可誘導出自噬。我用Hank's誘導了3h后電鏡觀(guān)察有30%細胞都有自噬這種現象,但不如國外報道的高。

    ⑦sigma的氯喹的貨號C6628。用氯喹做自噬抑制劑,293T細胞50uM就可以。1. 可以用雙蒸水配制2. 配制后4度保存

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    不同的自噬抑制劑機制不同。抑制的步驟也不同。有的不能抑制lc3的剪切,但能抑制后續的步驟,Chloroquine抑制自噬體與溶酶體的融合過(guò)程,autophgy不能完成,所以lc3才會(huì )累積。因此加了抑制劑lc3之后會(huì )比不加的要高。氯喹能提高溶酶體中的pH值,使溶酶體中的酸性水解酶喪失活性,從而導致“自噬溶酶體”不能降解,因此,位于自噬體和自噬溶酶體膜上的LC3不能按時(shí)降解,表現為L(cháng)C3熒光長(cháng)時(shí)間的保留或WB中LC3條帶變粗。

     

    ⑧Z-VAD-FMK(caspase-3 抑制劑)抑制EV71感染所引起的細胞凋亡,觀(guān)察細胞的自噬情況。研究發(fā)現,抑制細胞凋亡能增加LC3-I轉化為L(cháng)C3-II以及p62的降解。

    1.   雷帕霉素:作為以mTOR 為靶點(diǎn)尤為經(jīng)典的誘導劑已經(jīng)被廣為應用,推薦工作濃度為1μmol-10μmol;

     2.   氯喹:氯喹(Chloroquine)作為溶酶體的抑制劑,可以抑制自噬體與溶酶體的融合從而可以用來(lái)作為自噬以及自噬流的抑制劑用于實(shí)驗研究,推薦使用濃度:10umol-50umol。

     

    2、自噬誘導劑

     正常培養的細胞自噬活性很低,不適于觀(guān)察,因此,必須對自噬進(jìn)行人工干預和調節,經(jīng)報道的藥物有:

    (1) Bredeldin A / Thapsigargin / Tunicamycin :模擬內質(zhì)網(wǎng)應激

     (2) Carbamazepine/ L-690,330/ Lithium Chloride(氯化鋰):IMPase抑制劑(即Inositol monophosphatase,肌醇單磷酸酶)

     (3) Earle's平衡鹽溶液:制造饑餓

     (4) N-Acetyl-D-sphingosine(C2-ceramide):Class I PI3K Pathway抑制劑

     (5) Rapamycin:mTOR抑制劑

     (6) Xestospongin B/C:IP3R阻滯劑

     

    3、自噬抑制劑

     (1) 3-Methyladenine(3-MA):(Class III PI3K)hVps34 抑制劑

     (2) Bafilomycin A1:質(zhì)子泵抑制劑

     (3) Hydroxychloroquine(羥氯喹):Lysosomal lumen alkalizer(溶酶體腔堿化劑)

    衣霉素(tunicamycin from Slreptomyces sp., TM). Sigma-Aldrich 公司產(chǎn)品,貨號:T7765 ;溶于DMSO中配成儲存液,使用時(shí)DMSO終體積濃度不超過(guò)1/1000。

    3-甲基腺嘌呤(3-methyladenine,3-MA). Sigma-Aldrich 公司產(chǎn)品,貨號:M9281;溶于滅菌超純水制成儲存液。

    氯喹二磷酸鹽(chloroquine diphosphate salt,CQ) sigma-Aldrich 公司產(chǎn)品,貨號:C6628;溶于滅菌超純水中制成存液。

    雷帕霉素(rapamycin), 2.5mg/ml in DMSO, Sigma-Aldrich 公司產(chǎn)品,貨號:R8781;

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    4、MDC染色焚光顯微鏡檢測細胞自睡

    單丹黃酰尸胺(Monodansylcadaverine,MDC)是一種突光染料,被用作自吞泡的示蹤劑。具體操作步驟如下:

    (1)將處于對數生長(cháng)期的HepG2細胞按常規方法消化后接種于6孔板,每孔接種1x106個(gè)細胞;

    (2)細胞密度達到60%-70%時(shí),棄去培養液,小心用PBS洗1遍,分別用含TG濃度為0、0.5、1 nM的培養基及含Rapamycin (終濃度1 pM)的培養基繼續培養24 h;

    (3)棄上清PBS洗2遍,每孔加入含MDC(終濃度50 nM)的培養基于37 V、5% CCh的恒溫培養箱中避光溫育20 min;

    (4)取出六孔板置于勞光顯微鏡下,Ih內觀(guān)察細胞自唾發(fā)生情況并拍照。

     

    5、流式細胞術(shù)檢測細胞自噬發(fā)生率

    (1)取對數生長(cháng)期的HepG2細胞,接種于6孔板,培養24h之后,分別用含TG濃度為0、1、2、4、8uM的培養基繼續培養24h和0.5uM的TG作用不同時(shí)間(0、24、36、48、60h)后,取出六孔板,將上清收集到4 ml的離心管中;

    (2)每孔加入2ml含MDC(終濃度50nM)的MEM培養基,于37°C、5%0?的恒溫培養箱中避光孵育30 min;

    (3)將收集的上清2000rpm,離心5min;

    (4)棄掉上清,每管加入500ul含MDC(終濃度50 uM)的MEM培養基,吹打混句,37 °C避光解育30 min;

    (5)取出六孔板,PBS洗2次,0.25%的胰酶消化2min, 1 ml的PBS吹打混勻收集到1.5ml的離心管中,2000 rpm.離心5 min;

    (6)棄掉上清,加1ml的PBS重懸,2000rpm,離心5 min;

    (7)吸出800ul上清,剩余的200 ul吹打混勾;

    (8)鮮育完的上清,2000rpm,離心5 min;

    (9)棄掉上清,1ml的PBS吹打混勾收集到1.5 ml的離心管中,2000 rpm,離心5 min;

    (10)重復步驟(6)和(7);

    (11)將上述兩個(gè)相同濃度或相同時(shí)間點(diǎn)的兩管混勾,過(guò)300目銅網(wǎng)上機檢測。流式細胞

    儀以488nm激發(fā)波長(cháng)測定MDC染色的熒光強度。

    LC3B WB: 1:2000

    條件是15% SDS-PAGE, 正常跑膠至下沿0.5cm即可,200mA 濕轉45min 正常0.45的PVDF,5%牛奶封閉1h,4C過(guò)夜搖動(dòng)孵育,洗抗體3*5min即可

    LC3B的Western-blot檢測,配置的15%的分離膠,濕轉250mA,60min

     

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