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    質(zhì)粒電泳3條帶?5條帶?一文告訴你原因

    發(fā)布時(shí)間: 2024-06-04  點(diǎn)擊次數: 274次

    1.相信很多小伙伴將質(zhì)粒電泳后發(fā)現,質(zhì)粒不是單一條帶,而是出現了很多條帶,例如下圖:

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    2.質(zhì)粒為什么出現這樣的情況?

    一般理解來(lái)說(shuō),質(zhì)粒DNA應如圖2(左)所示的簡(jiǎn)單環(huán)狀結構。然而,雙鏈環(huán)狀DNA的分子軸變形或雙螺旋的扭曲,導致閉合環(huán)狀DNA中每個(gè)螺旋轉彎的實(shí)際堿基對數量發(fā)生變化,或者導致螺旋軸發(fā)生規則的空間變形,產(chǎn)生拓撲結構,形成質(zhì)粒DNA的超螺旋性狀(圖2右)。

    質(zhì)粒電泳3條帶?5條帶?一文告訴你原因


    因此,不同的拓撲結構將使質(zhì)粒DNA形成多種形式,包括共價(jià)封閉圓形(CCC)形式、開(kāi)放圓形(OC)形式(也稱(chēng)為“缺口形式")和線(xiàn)性形式(通常通過(guò)奇特的限制性消化獲得)。在CCC形式中,兩條DNA鏈是共價(jià)閉合的,DNA是超螺旋的。這種亞型的結構最緊密。如果DNA斷裂產(chǎn)生缺口,就會(huì )產(chǎn)生OC,卷曲也就消失了。當兩條線(xiàn)在同一位置斷裂時(shí),就會(huì )產(chǎn)生線(xiàn)性形式。此外,質(zhì)??赡芤怨丫垠w形式出現,例如串聯(lián)體,而串聯(lián)體又可能以不同的異構體形式存在。所有這些形式都可以通過(guò)瓊脂糖凝膠電泳觀(guān)察到。但出現多少種條帶會(huì )根據你的質(zhì)粒提取技術(shù)、質(zhì)粒的新鮮程度、電泳液的配置以及瓊脂糖凝膠的配置等有所不同。


    2.怎么區分質(zhì)粒的電泳條帶?

    一般來(lái)說(shuō),質(zhì)粒遷移速度由快到慢分別是共價(jià)封閉原形(超螺旋)形式、線(xiàn)性和開(kāi)放圓環(huán)(開(kāi)環(huán))形式,并伴隨著(zhù)其他形式。原因是:電泳DNA遷移速率與分子大小和構象相關(guān),分子構象越大,空間位阻阻力越大。超螺旋結構較為緊密,因此跑的快;開(kāi)環(huán)質(zhì)粒由于DNA斷開(kāi),阻力增大,因此跑的最慢。


    3.怎么驗證質(zhì)粒是否可用?

    綜上所述,質(zhì)粒存在多少條帶與多種因素相關(guān),沒(méi)有存在絕對的衡量標準。但如果用限制性?xún)惹忻赶|(zhì)粒DNA,只會(huì )出現一條清晰的條帶。并且,由于酶切形成線(xiàn)性化DNA片段,其電泳遷移速率會(huì )比對照組原始質(zhì)粒的超螺旋結構速度慢,可以檢驗質(zhì)粒是否被切開(kāi)。


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