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實(shí)時(shí)熒光定量PCR的優(yōu)化(二)
發(fā)布時(shí)間: 2021-10-12 點(diǎn)擊次數: 1029次如果你所研究的靶序列有前人建立過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR的方法,就可以在公共數據庫中查找,查看擴增效率、特異性、靈敏度等信息,省去從頭開(kāi)始的時(shí)間。
注意,使用前人建立的方法前,需要再次驗證這個(gè)方法的參數是不是符合描述。防止長(cháng)時(shí)間重復實(shí)驗,卻得不到想要的結果的人間慘劇。
推薦的公共引物探針數據庫:
1、RTPrimerDB
這個(gè)數據庫內的約6000個(gè)基因,來(lái)自人、擬南芥、大鼠等21個(gè)物種,相對其他數據庫豐富。這些引物和探針,也是經(jīng)過(guò)驗證的,70%已發(fā)表。使用該數據庫時(shí)建議通過(guò)網(wǎng)絡(luò )代理登錄。
2、PrimerBank
這個(gè)數據庫內的探針引物是通過(guò)算法設計得到的,主要包括人和小鼠的基因。數據庫內的小鼠引物,經(jīng)過(guò)廣泛驗證后,被證實(shí)有83%的成功率。
3、Real Time PCR Primer Sets
這個(gè)數據庫內的引物和探針都經(jīng)過(guò)測試、優(yōu)化,針對多種生物設計,包括人、小鼠、大鼠等的基因。
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