相對定量常用于測定兩個(gè)不同樣品中靶基因量的差異，例如使用實(shí)時(shí)RT-PCR法定量檢測mRNA水平的實(shí)驗。

進(jìn)行相對定量實(shí)驗分析兩個(gè)不同樣品的實(shí)驗數據時(shí)，需要對數據進(jìn)行歸一化處理，設置其中一個(gè)樣品的靶基因表達量為“1"。這個(gè)樣品稱(chēng)為校準品，常使用表達恒定的內參基因。

通常，校準品歸一化后，待測樣品靶基因表達量以比“1"增加或降低n倍來(lái)表示，來(lái)顯示表達量的差異。

值得注意的是，實(shí)驗必須從等量原料中取得校準品和待測樣品的靶基因，否則比較無(wú)意義。

與絕對定量相比，相對定量實(shí)驗優(yōu)點(diǎn)在于內參基因的使用，能規避實(shí)驗操作產(chǎn)生的差異，而且不需要制作標準曲線(xiàn)。