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qPCR實(shí)驗結果分析基本步驟(一)
發(fā)布時(shí)間: 2021-10-15 點(diǎn)擊次數: 10671次實(shí)時(shí)熒光定量PCR實(shí)驗會(huì )產(chǎn)生大量實(shí)驗數據,一般可以用PCR儀自帶的軟件進(jìn)行收集、分析。但即使有了方便可靠的軟件,我們也需要對原始數據進(jìn)行檢查、再分析,評估數據的質(zhì)量和可靠性。
這需要三個(gè)基本的步驟。
第一步,查看擴增曲線(xiàn),有必要時(shí)調整基線(xiàn)和閾值。
Ct值由基線(xiàn)和閾值計算得來(lái),所以他們的值對結果影響很大。軟件會(huì )給出1個(gè)默認的基線(xiàn)和閾值,但不一定是最合適的,需要我們進(jìn)行手動(dòng)調整。
首*行基線(xiàn)的調整。
一般范圍是循環(huán)數3~15,使得靶基因的擴增信號大于背景噪聲。出現不正常的擴增曲線(xiàn),通常是因為設置了不正常的基線(xiàn),需要對單個(gè)孔進(jìn)行設置。
比較好的做法是,基線(xiàn)的最小值(起始循環(huán)數)設置在背景噪聲的尾巴后,最大值(結束循環(huán)數)設置為擴增起始點(diǎn)。
循環(huán)范圍在5個(gè)循環(huán)就可以,具體跟擴增曲線(xiàn)的對數圖來(lái)設定。
擴增曲線(xiàn)的對數圖是什么?下期告訴你
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