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    臨床M2巨噬細胞相關(guān)基因輔助治療胰腺導管腺癌

    發(fā)布時(shí)間: 2021-11-02  點(diǎn)擊次數: 905次

    胰腺導管腺癌(PDAC)是全球七大癌癥相關(guān)死亡原因,也是最常見(jiàn)的人類(lèi)惡性腫瘤之一。根據2018年全球癌癥統計,大約有45.9萬(wàn)名新確診患者和近43.2萬(wàn)人死亡患者。由于早期準確診斷和腫瘤快速進(jìn)展等困難,大量PDAC(胰腺導管腺癌)病例在診斷時(shí)出現臨床晚期或遠處轉移。因此,開(kāi)發(fā)新的、可靠的預后評估和療效預測指標以進(jìn)一步推進(jìn)針對性治療具有十分重要的意義。

    越來(lái)越多的證據支持浸潤M2巨噬細胞在胰腺導管腺癌(PDAC)的腫瘤進(jìn)展中起關(guān)鍵作用。然而,對M2巨噬細胞浸潤和中樞基因(FAM53B)在臨床結局和免疫治療中的生物學(xué)作用缺乏全面的分析。近期有一個(gè)研究團隊針對M2巨噬細胞相關(guān)基因表達進(jìn)行研究,以期望能探索出評估PDAC預后及療效的新指標。


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    研究人員合并了兩個(gè)PDAC樣本數據集,GSE16515和TCGA-PAAD,以研究M2巨噬細胞分析的潛在作用。使用CIBERSORT算法獲得M2巨噬細胞圖譜,然后通過(guò)WGCNA發(fā)現與M2巨噬細胞相關(guān)較為顯著(zhù)的模塊。然后,利用多cox回歸模型進(jìn)一步確定模塊中的候選基因,最終確定5個(gè)關(guān)鍵基因。然后,建立了多基因風(fēng)險模型和綜合預后圖。在后續分析和外部試驗組(ICGC-PACA-CA)中驗證其預后價(jià)值。隨后,研究潛在的信號通路和治療預測的風(fēng)險評分。最后,進(jìn)一步探討FAM53B在預后預測、免疫浸潤和免疫治療中的生物學(xué)功能,為PDAC的臨床治療策略提供可靠的見(jiàn)解。

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    22個(gè)候選基因的LASSO系數譜

    為了進(jìn)一步研究候選基因的預后價(jià)值,研究人員從TCGA-PAAD項目中提取了表達數據和隨訪(fǎng)信息。在單因素Cox分析的幫助下,鑒定了22個(gè)M2巨噬細胞相關(guān)基因,具有顯著(zhù)的預后價(jià)值。并對這些hub基因進(jìn)行了Lasso回歸,識別出PDAC中與預后相關(guān)的9個(gè)M2巨噬細胞相關(guān)基因。進(jìn)行多因素COX回歸分析,確定5個(gè)M2巨噬細胞相關(guān)基因(FAM53B、SPINK2、ABCB4、GH1、INTU)為中心基因,所有這些基因均被認為是有益的預后指標(所有HRs <1,表S6)。使用HPA數據庫來(lái)探索PDAC樣品中的蛋白表達水平。結果顯示,相對于正常樣本,腫瘤組織中的蛋白(ABCB4、FAM53B和INTU)明顯失調。此外,在低表達和高表達基因亞組之間,生存分析顯示,大多數hub基因mRNA表達異常導致總體生存時(shí)間顯著(zhù)不同。


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    采用ROC分析評估預后特征的預測價(jià)值

    綜上所述,建立基于M2巨噬細胞的風(fēng)險評分,可作為預測PDAC臨床結局的穩健的預測性生物標志物和預后指標,為PDAC的治療管理提供指導。


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